（一）主要修复方法
污染土壤生态修复的方法具有综合性，强调各种技术的优化组合，注重以多种方法达到对土壤中PAHs微生物的降解，从而形成一个可以自我调节的修复系统。污染土壤的生态修复方法主要以生物技术为主，辅助使用地理技术，实现不同因素的优化组合，形成良性的循环系统，达到高效修复土壤的目标。多种方法的结合并不是任意方法的随意搭配，需要根据污染土壤的实际情况采用具体的、科学的、合理的修复方法。在修复时应科学定位，确保修复方法的有效性。特别是当前土壤污染以复合污染为主的情况下，应当根据土壤中存在的大量微生物采用科学的修复体系，实现对物理的、化学的、生物的方法的综合运用，从而确保微生物具有必要的生存条件，不断还原土壤的湿度、温度，氧化条件。不同地域的土壤条件有所不同，应当根据地域差异性采用具体的土壤污染治理方法，设计合理的修复方案，对生态修复的过程进行动态的监测，这样材能提高修复的效率。生态修复需要根据污染土壤的各种动植物状况，能量的流动状态，以及生态过程特点保证污染物的有效去除，达到治理的最佳效果与最低消耗。
（二）具体修复应用
不同的污染物应当采用具体的修复方法，生态修复方法目标主要应用于重金属污染与有机污染物的修复当中。首先，重金属污染物的生态修复应当优化植物选择，根据圈效应合理的控制修复强化措施。例如，对Zn的吸收可以采用植物天藍遏蓝菜，还要根据污染物的临界含量特征标准确定临界值，转移特征标准，耐性特征标准，对多个单一污染物超积累植物进行合理搭配。分子生物学的快速发展使得土壤生态修复对植物超积累研究更加深入，以及重金属植物体内运输机制，植物对重金属的解毒和转运蛋白质方式加以利用，根据植物的有机酸化环境促进土壤重金属融解更加深入。重金属污染处置还要在生态修复的基础上适当的增加添加剂，从而更好的发挥植物根部在吸收重金属含量的作用，达到提高土壤修复潜力的目标。其次，有机污染物修复主要运用微生物修复，强调合理的搭配化学与生物化学方法进行强化。微生物修复主要运用微生物对有机污染物进行降解，一般植物的根部对有机污染物的生态修复有一定的复作用，应当运用微生物的生命活动进行氮代谢，发酵与共代谢，有处理时还可以采用电化学方法，这样可以构成一个完整的修复单元，这样可以提高有机物的污染降解效率，达到提升生态修复效率的目标。
（三）提高土壤修复的效率
目前我国更强调完善土壤修复的效率，注重降低土壤修复时间成本，减少污染物在土壤留存的时间。土壤污染物的修复效率受到污染物的物理化学性质影响，污染物的分子大小、形态、半衰期、解离常数、蒸汽压等影响污染物的修复效率。为了提高土壤污染物修复的效率，提高土壤污染修复的经济性，降低土壤污染物修复的成本，还要充分考虑土壤污染物的因子情况，强调提高植物吸收污染物的效率。